国税庁の「青色申告決算書(農業所得用)」の様式に合わせて科目が用意されていますので、大幅な変更は必要ありません。
ただし、収入科目については、実情に合わせて登録する必要があります。

収入科目は、科目・残高登録の収入画面で「田畑」~「畜産物」のグループに登録します。
また、登録した科目名は、決算書の内訳書(1ページ目)にある「(A)収入金額の内訳」の「区分」に反映されます。